ImmGen을 사용하여 면역 시스템 유전자 발현을 탐색해보세요.
ImmGen은 다양한 쥐 및 인간 면역 시스템 세포에서 유전자 발현 수준에 초점을 맞춘 교육 도구입니다. 사용자는 검색 창에 유전자 이름 또는 별칭을 입력하여 히트 목록을 볼 수 있고 이를 스와이프하여 탐색할 수 있습니다. 이 앱은 B 세포, T 세포, 및 Myeloid 세포와 같은 다양한 면역 시스템 세포 계통에서 선택한 유전자의 발현 수준을 나타내는 독특한 '열도 바코드(heatmap barcode)'를 제시합니다.
사용자는 쥐 RNA-seq, 쥐 마이크로어레이, 및 인간 RNA-seq 세 가지 데이터 세트 간에 전환할 수 있어 유전자 발현에 대한 포괄적인 통찰을 제공합니다. 세포 계통 아이콘을 탭하면 막대 차트를 통해 발현 데이터를 시각화할 수 있습니다. 또한 데이터 시각화 선호도에 따라 로그 및 선형 축 간 전환을 허용합니다.
더 심층적으로 알아보려면 사용자는 면역 시스템 내 주요 인구군과의 상관 관계를 보여주는 '유전자 집합(gene constellation)' 보기를 통해 관련 유전자를 탐색할 수 있습니다. ImmGen은 국립보건원(NIAID)이 지원하는 면역학 유전체 프로젝트에서 개발한 귀중한 자원입니다.
